同江口岸历史悠久，早在1904年就有商号与俄国商人进行贸易活动，1909年同江曾为黑龙江一线中俄贸易重要口岸。1958年，国务院批准设立同江口岸，出现了对苏国贸、省贸和边贸同步进行的活跃局面，后因“文革”中断了中苏贸易，1986年，国务院再度批准恢复同江为国家一类口岸，并实现当年开通当年过货，对外出口大豆25700吨，1987年2月24日，经国务院批准撤县建市。1988年黑龙江省政府批准同江为通贸兴边试验区。1994年，同江口岸又被外交部批准为国际客货运输口岸，可以通过第三国人员。